1979年の「機動戦士ガンダム」から20周年を記念し、シリーズの生みの親である富野由悠季が新たに手がけたTVアニメ「∀（ターンエー）ガンダム」（1999～2000）を再編集して製作された劇場版2部作の前編。かつて荒廃した地球から月に移住した人類の末裔ムーンレィスは、およそ2000年の時を経て地球への帰還という悲願に向けて動き出す。先遣調査隊の一員として地球へ降りたムーンレィスの少年ロラン・セアックは、北アメリア大陸のイングレッサで鉱山業を営むハイム家の運転手となり、現地に溶け込んでいく。それから2年後、ムーンレィスの地球降下作戦が本格化するが、地球に住む人々との軋轢や誤解から争いが勃発。そんな時、地球の大地に眠っていたかつての地球文明の遺産、∀ガンダムが動き出し、ロランはそのパイロットとしてムーンレィスと相対することになるが。